Curah hujan yang tinggi membuat beberapa daerah di Indonesia dilanda banjir. Seperti yang terjadi di Provinsi Sulawesi Selatan. Tahun baru 2019 diwarnai dengan banjir yang cukup meluas di provinsi ini. Malindo bekerjasama dengan Kementerian Pertanian RI mengirimkan bantuan untuk masyakarakat  yang kesulitan air bersih dan makanan berupa air mineral, mie instan, susu dan telur. Bantuan diserahkan kepada panitia tanggal 26 Januari 2019 yang diterima oleh Sekdit Ditjen Peternakan dan Kesehatan Hewan, Ir. Nasrullah.

Musibah banjir kemudian berlanjut di bulan Juni 2019 yang menimpa beberapa daerah di Sulawesi Tenggara seperti Kolaka Timur dan Konawe Utara. PT Malindo Feedmill Tbk bersama dengan perusahaan dan pemerintah di bawah Kementerian Pertanian RI menyalurkan kepeduliannya dalam bentuk CSR dengan mengirimkan bantuan air mineral, mie instan dan telur ayam. Bantuan disalurkan tanggal 13 Juni 2019.

Sementara itu banjir yang cukup besar juga kembali menimpa Sulawesi Selatan seperti yang terjadi di Kabupaten Soppeng, Kabupaten Wajo, Sidrap, Pinrang, Enrekang dan beberapa kabupaten lainnya.  Menteri Pertanian RI, Amran Sulaiman melepas pengiriman bantuan perusahaan termasuk bantuan Malindo di Maros tanggal 15 Juni 2019. Total bantuan Malindo untuk korban banjir di dua provinsi ini sekitar Rp. 51 juta.